سنگل انو ٹیکنالوجی میں رہنماؤں
حساسیت، رفتار اور حاصل قابل ترتیب کے حدود کے باوجود، پی این اے میں بیان کردہ نئے ترتیب کے طریقہ کار ناول تھے اور ان کی سرمایہ کاری کے ماہرین کی آنکھ کو پکڑنے کے لئے کافی وعدہ دکھایا جنہوں نے اپنی ٹیکنالوجی میں سرمایہ کاری کے بارے میں پروفیسر سے رابطہ کیا. ایک طویل عرصے سے عملے کے رکن اور ریسرچ سینئر ڈائریکٹر ڈاکٹر تیموتی ہارسس کے مطابق، اس ٹیکنالوجی کے بارے میں کچھ بھی ہونا ضروری ہے کہ یہ کس طرح کی سرمایہ کاروں کو تلاش کر رہا ہے. سائنسدانوں کا یہ دوسرا راستہ ہے !
1 اپریل، 2003 کو PNAS اشاعت جاری کیا گیا تھا، نئی کمپنی کے لئے فنانس کا پہلا دور دسمبر 19، 2003 اور جنوری 2، 2004 کو شروع کیا گیا تھا، ہیلیکیس نے 5 ملازمین سمیت 5 ملازمتوں سمیت ڈاکٹر حریث پیمائش سائنس اور واحد انوک ٹیکنالوجی پر ماہر. ہیلیسس فی الحال کیمبرج ایم اے، امریکہ اور سرمایہ کاری کے فنانس کے دو دوروں اور 27 مئی، 2007 کو آئی پی او کے بعد واقع ہے، اب یہ عام طور پر NASDAQ: HLCS کے تحت تجارت کی جاتی ہے.
ہیلیکوس اپریل 2008 میں سائنس میگزین میں بیان کردہ طور پر M13 وائرس جینوموم کی ترتیب کے ساتھ معتدل جینیاتی تجزیہ کی تکنالوجیوں میں خاص طور پر، ایک سچل سنگل انکل سیچریشن ( ٹی ایس ایم ایم ٹی ایم ) کی ٹیکنالوجی کا مشورہ دیتا ہے. خاص ٹی ایس ایم ایم ٹی ایم پلیٹ فارم ہیلس اسکوپ ٹی ایم سنگل کا استعمال کرتا ہے. انوکل Sequencer .
ڈاکٹر ہارس کے مطابق، یہ خاص منصوبہ جنوری 2004 میں شروع ہو چکا تھا، اور جون 2005 تک انہوں نے سائنس کے کاغذ میں بیان کردہ میڈیکل متعلقہ ترتیب کو کامیابی سے M13 وائرس کی ترتیب دی تھی.
TSMS TM کام کیسے کرتا ہے؟
تقریبا 100-200 بیس جوڑوں کے ڈی این اے کی ایک بھوک پٹیاں اینجیمز کا استعمال کرتے ہوئے چھوٹے ٹکڑوں میں کاٹ جاتا ہے، اور پالئیےسٹر کی پٹی شامل ہیں. اس کے بعد قصر ترین ہیلی کاپٹر ہیلیکیس کے بہاؤ سیل پلیٹ کو ہائبرڈائز کیا جاتا ہے، جس میں اس کی سطح پر پابندیاں ملی ہیں. ہر ہائبرڈائزڈ ٹیمپلیٹ ایک بار میں ترتیب ہے. لہذا اربوں فی دوڑ پڑھ سکتے ہیں. لیبلنگنگ "کوئڈ" میں انجام دیا جاتا ہے جس میں مشتمل 4 سائیکل ہر ایک، 4 نیوکللوٹایڈ اڈوں میں سے ہر ایک کے لئے. فلوروسینٹ لیبلڈ اڈوں کو شامل کیا جاتا ہے، اور آلہ میں لیزر لیبل کو روشن کرتا ہے، اسے پڑھنا پڑتا ہے جس میں کنارے نے خاص طور پر بیس بیس لیبل لگایا ہے. لیبل پھر صاف کیا جاتا ہے، اور اگلے چلے کا ایک نیا بیس شروع ہوتا ہے. ہر بنیاد (4 سائیکل) کے ساتھ بہاؤ سیل کے ساتھ علاج کیا گیا ہے کے بعد، کواڈ مکمل ہو گیا ہے، اور ایک نیا ابتدائی نیوکلیوٹائیڈ بیس کے ساتھ دوبارہ شروع ہوتا ہے.
فی الحال، ہیلسسکپ TM کی لمبائی میں تقریبا 55 بیس جوڑوں کے ڈی این اے ٹکڑے ٹکڑے پڑ سکتے ہیں. اس سلسلے میں زیادہ اڈوں، ایک نمونہ میں استعمال کیا جا سکتا ہے کہ strands کے نچلے حصے، کیونکہ کچھ strands عمل کے دوران کو بڑھانے کے لئے جدوجہد.
20 یا اس اڈوں کی پڑھائیوں کے بارے میں، تقریبا 86٪ تاروں کا استعمال کیا جا سکتا ہے. طویل عرصے سے پڑھتا ہے (55+ بیس جوڑوں) اس فی صد میں تقریبا 50 فیصد کمی ہے.
سنگل انو فوائد
جبکہ کئی دیگر کمپنیوں کو اعلی ترتیب کے پلیٹ فارمز، مختلف مختلف ریجنٹس، موازنہ قیمتوں پر، اور 25-40 بیس جوڑوں کے مختصر پڑھنے کے ساتھ مختلف ترتیب کاری کی طرف سے مختلف تجزیات کی پیشکش کرتے ہیں، صرف ہیلیکوس صرف ایک ہی وقت میں ڈی این اے کی ترتیب ایک ایک نیوکللیٹ پڑھتے ہیں. لیبلنگ کی تکنیک جس میں ایک اکیلے پر پڑھنے کے لئے کافی حساس ہے. دیگر طریقوں کی ضرورت ہوتی ہے کہ ڈی این اے پر زور دیا جائے ( پی سی آر کا استعمال کرتے ہوئے) آرڈرنگ سے پہلے ایک سے زیادہ (لاکھ) کاپیاں بنانے کے لئے. اس پر عملدرآمد کے دوران پولیمر اینجیمز کی طرف سے پروسیسنگ کی غلطیوں کی وجہ سے ایک اہم ڈگری کی غلطی کا امکان متعارف کرایا جاتا ہے.
اپریل 2008 تک، ہیلسسکپٹی ٹی نے مبینہ طور پر ہر روز اربوں نیلیولوٹ اڈوں کو ترتیب دینے میں مدد کی تھی.
ہیلیکس ذاتی میڈیکل اتحاد کے ایک رکن ہیں اور "$ 1000 جینوم" گرانٹ فنڈ موصول ہوئی ہے. ایک دن میں $ 1000 جینوم ایک متوقع مقصد ہے جس میں sequencer فی گھنٹہ ارب اڈوں پر عملدرآمد کرنے کی ضرورت ہوگی. فی الحال، پروٹوٹائپ sequencer پورے جینوم کی شناخت کے لئے سال لگے گا، جو 1000 ڈالر سے زائد خرچ کرے گا.
TSMSTM ٹیکنالوجی کے لئے ایپلی کیشنز بہت سے ہیں، بشمول انسانوں میں جینیاتی متغیرات اور بیماریوں کے عوامل کا تعین کرنے کے لئے، بیکٹیریا میں اینٹی بائیوٹک مزاحمت، وائرس میں ویرت اور زیادہ سے زیادہ پرجاتیوں کا پتہ لگانا. کسی بھی جین کے بغیر ایک جین کا پتہ لگانے کی صلاحیت ماحولیاتی مائکروبالوجی میں بہت ممکنہ استعمال ہے، کیونکہ جینیاتی تکنیک اکثر قابل، غیر زراعت مائکروجنزمیز یا مٹی اور دوسرے مچھروں میں پایا جاتا ہے جو موجودہ طریقوں کی طرف سے تنہائی کو روکنے کے لئے استعمال کرنے کے لئے استعمال کیا جاتا ہے. اس کے علاوہ، ماحولیاتی نمونے کی نوعیت عام طور پر پی سی آر کا استعمال کرتے ہوئے جین امپریشن کے لئے مشکلات پیش کرتی ہے، آلودگی کے مسائل کے باعث. تاہم، یہ مشکلات پر قابو پانے کی بھی ضرورت ہوگی تاکہ ٹییم ایس ایم ایم میں استعمال ہونے والی پولیمریج اینجیمز مداخلت کے بغیر کام کریں.
واحد انوکل کے ترتیب کے پیچھے اصول کافی بنیادی ہے، اور آپ حیران ہو سکتے ہیں کیوں کہ اس سے پہلے کوئی بھی اس نے نہیں سوچا. اگرچہ یہ کافی آسان لگتا ہے، اس طرح کے پلیٹ فارم کو ترقی دینے میں بہت سے تکنیکی اجزاء اور ہیلسس مصروف رکھنے کے لۓ بہت سارے چیلنج ہیں، بشمول نئے کیمیائی ردعمل اور ری ایجنٹ، پلیٹ اور اعلی throughput قارئین کی ترقی بھی شامل ہیں. واحد بنیاد پر ایک واحد لیبل کے فلوروسینس کا پتہ لگانے کی صلاحیت انتہائی سنجیدگی سے متعلق سازوسامان کی ضرورت ہوتی ہے، اور لیبلنگ اور سگنل کا پتہ لگانے کے لئے کیمسٹری مداخلت کو کم کرنے اور ڈی این اے پالیمریز کی فدیل کو بہتر بنانے کے حق میں صرف حق کی ضرورت ہوتی ہے کیونکہ یہ غیر موصلیت کے سانچے اور لیبلڈ نیوکللیڈس. یہ ہیلیسیس کے سامنے آنے والے چند چیلنج ہیں کیونکہ یہ کسی بھی وقت 1000 ڈالر، 1 دن انسانی جینوم فراہم کرنے کی امیدوں میں اس ٹیکنالوجی کی ترقی میں جاری رہتی ہے.